MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 58805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017474	TA	3	6	1	6	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017474	TCA	2	6	17	22	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017474	GGA	2	6	66	71	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017474	GAA	2	6	129	134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821701
5	NC_017474	CGGT	2	8	142	149	0 %	25 %	50 %	25 %	385821701
6	NC_017474	ACAG	2	8	164	171	50 %	0 %	25 %	25 %	385821701
7	NC_017474	CTT	2	6	220	225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821701
8	NC_017474	CAGC	2	8	333	340	25 %	0 %	25 %	50 %	385821701
9	NC_017474	GAA	2	6	369	374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821701
10	NC_017474	GCT	2	6	474	479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821701
11	NC_017474	ACA	2	6	504	509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821701
12	NC_017474	TTTA	2	8	522	529	25 %	75 %	0 %	0 %	385821701
13	NC_017474	TGG	2	6	530	535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821701
14	NC_017474	ATA	2	6	589	594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821701
15	NC_017474	CAG	2	6	598	603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821701
16	NC_017474	CAAAC	2	10	660	669	60 %	0 %	0 %	40 %	385821701
17	NC_017474	CTG	2	6	708	713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821701
18	NC_017474	GAT	2	6	720	725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821701
19	NC_017474	T	6	6	732	737	0 %	100 %	0 %	0 %	385821701
20	NC_017474	CA	3	6	752	757	50 %	0 %	0 %	50 %	385821701
21	NC_017474	GAA	2	6	759	764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821701
22	NC_017474	T	6	6	765	770	0 %	100 %	0 %	0 %	385821701
23	NC_017474	GCCT	2	8	826	833	0 %	25 %	25 %	50 %	385821701
24	NC_017474	GGTT	2	8	859	866	0 %	50 %	50 %	0 %	385821701
25	NC_017474	TAA	2	6	875	880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821701
26	NC_017474	TGTC	2	8	886	893	0 %	50 %	25 %	25 %	385821701
27	NC_017474	ACGT	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	385821701
28	NC_017474	TGA	2	6	1121	1126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821701
29	NC_017474	GAAA	2	8	1207	1214	75 %	0 %	25 %	0 %	385821701
30	NC_017474	GC	3	6	1260	1265	0 %	0 %	50 %	50 %	385821701
31	NC_017474	CGG	2	6	1307	1312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821701
32	NC_017474	A	6	6	1345	1350	100 %	0 %	0 %	0 %	385821701
33	NC_017474	TGA	2	6	1370	1375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821701
34	NC_017474	GTT	3	9	1504	1512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017474	CTATTA	2	12	1543	1554	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017474	TATAT	2	10	1567	1576	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017474	AGG	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017474	ATG	2	6	1644	1649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821702
39	NC_017474	AAC	2	6	1672	1677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821702
40	NC_017474	CAACG	2	10	1771	1780	40 %	0 %	20 %	40 %	385821702
41	NC_017474	AAT	2	6	1787	1792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821702
42	NC_017474	TCA	2	6	1911	1916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821702
43	NC_017474	CAT	2	6	2197	2202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821702
44	NC_017474	A	6	6	2256	2261	100 %	0 %	0 %	0 %	385821702
45	NC_017474	CAA	2	6	2455	2460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821702
46	NC_017474	GAA	2	6	2537	2542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821702
47	NC_017474	CAA	2	6	2554	2559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821702
48	NC_017474	GCG	2	6	2565	2570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821702
49	NC_017474	AGA	2	6	2689	2694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821702
50	NC_017474	TCA	2	6	2715	2720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821702
51	NC_017474	CAA	2	6	2753	2758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017474	A	6	6	2771	2776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017474	AG	3	6	2783	2788	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017474	TGA	2	6	2789	2794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017474	T	6	6	2808	2813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017474	ATA	3	9	2861	2869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017474	ACGT	2	8	2961	2968	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017474	GAA	2	6	2976	2981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017474	TAG	3	9	3007	3015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017474	TCC	2	6	3027	3032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_017474	AT	3	6	3033	3038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017474	ATA	3	9	3077	3085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017474	AT	3	6	3094	3099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017474	ATA	2	6	3112	3117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017474	AAAAGT	2	12	3348	3359	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017474	AGT	2	6	3498	3503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017474	TAAT	2	8	3513	3520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017474	GAC	2	6	3532	3537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017474	ACA	2	6	3596	3601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821703
70	NC_017474	T	6	6	3619	3624	0 %	100 %	0 %	0 %	385821703
71	NC_017474	GAG	2	6	3725	3730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385821703
72	NC_017474	GAT	2	6	3755	3760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821703
73	NC_017474	GGCC	2	8	3772	3779	0 %	0 %	50 %	50 %	385821703
74	NC_017474	TGC	2	6	3843	3848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821704
75	NC_017474	ACA	2	6	3856	3861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821704
76	NC_017474	AATC	2	8	3923	3930	50 %	25 %	0 %	25 %	385821704
77	NC_017474	TCA	2	6	4065	4070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821704
78	NC_017474	AAC	2	6	4100	4105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821704
79	NC_017474	CT	3	6	4111	4116	0 %	50 %	0 %	50 %	385821704
80	NC_017474	GCG	2	6	4191	4196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821704
81	NC_017474	AGC	2	6	4274	4279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821704
82	NC_017474	AGC	2	6	4295	4300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821704
83	NC_017474	ATC	2	6	4307	4312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821704
84	NC_017474	TGAC	2	8	4343	4350	25 %	25 %	25 %	25 %	385821704
85	NC_017474	GC	4	8	4384	4391	0 %	0 %	50 %	50 %	385821704
86	NC_017474	GTT	2	6	4395	4400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821704
87	NC_017474	TGC	2	6	4419	4424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821704
88	NC_017474	AGC	2	6	4550	4555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821704
89	NC_017474	GC	3	6	4558	4563	0 %	0 %	50 %	50 %	385821704
90	NC_017474	GAT	2	6	4603	4608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821704
91	NC_017474	GTT	2	6	4611	4616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821704
92	NC_017474	CAA	2	6	4660	4665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821704
93	NC_017474	CAC	2	6	4668	4673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385821704
94	NC_017474	TGT	2	6	4754	4759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821704
95	NC_017474	ACC	2	6	4828	4833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385821704
96	NC_017474	ATC	2	6	4861	4866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821704
97	NC_017474	TGA	2	6	4890	4895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821704
98	NC_017474	TGA	2	6	4959	4964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017474	AGG	2	6	5033	5038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017474	AAGA	2	8	5055	5062	75 %	0 %	25 %	0 %	385821705
101	NC_017474	GAAGA	2	10	5070	5079	60 %	0 %	40 %	0 %	385821705
102	NC_017474	GGC	2	6	5090	5095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821705
103	NC_017474	ATG	2	6	5101	5106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821705
104	NC_017474	CCAG	2	8	5107	5114	25 %	0 %	25 %	50 %	385821705
105	NC_017474	AGC	2	6	5178	5183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821705
106	NC_017474	CAT	2	6	5193	5198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821705
107	NC_017474	TGA	2	6	5228	5233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821705
108	NC_017474	GCTG	2	8	5237	5244	0 %	25 %	50 %	25 %	385821705
109	NC_017474	TTGAAG	2	12	5260	5271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821705
110	NC_017474	ATA	2	6	5281	5286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821705
111	NC_017474	GGT	2	6	5385	5390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821705
112	NC_017474	CGG	4	12	5396	5407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821705
113	NC_017474	GTG	2	6	5491	5496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821705
114	NC_017474	TAC	2	6	5505	5510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821705
115	NC_017474	GGCAC	2	10	5556	5565	20 %	0 %	40 %	40 %	385821705
116	NC_017474	GAT	2	6	5637	5642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821705
117	NC_017474	ACC	2	6	5652	5657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385821705
118	NC_017474	GC	3	6	5714	5719	0 %	0 %	50 %	50 %	385821705
119	NC_017474	GGC	2	6	5754	5759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821705
120	NC_017474	A	6	6	5790	5795	100 %	0 %	0 %	0 %	385821705
121	NC_017474	GACAA	2	10	5830	5839	60 %	0 %	20 %	20 %	385821705
122	NC_017474	TTG	2	6	5892	5897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821705
123	NC_017474	CAA	2	6	5906	5911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821705
124	NC_017474	GGC	2	6	5928	5933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821705
125	NC_017474	GAT	2	6	6015	6020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821705
126	NC_017474	GAT	2	6	6033	6038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821705
127	NC_017474	CGG	2	6	6055	6060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821705
128	NC_017474	GGT	2	6	6137	6142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821705
129	NC_017474	GGC	2	6	6245	6250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821705
130	NC_017474	CCTG	2	8	6302	6309	0 %	25 %	25 %	50 %	385821705
131	NC_017474	ACA	2	6	6322	6327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821705
132	NC_017474	ATT	2	6	6353	6358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821705
133	NC_017474	TCG	2	6	6361	6366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821705
134	NC_017474	TGG	2	6	6380	6385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821705
135	NC_017474	GAA	2	6	6489	6494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821705
136	NC_017474	CCGATG	2	12	6583	6594	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385821705
137	NC_017474	TTG	2	6	6618	6623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821705
138	NC_017474	GCC	2	6	6686	6691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821705
139	NC_017474	AT	3	6	6725	6730	50 %	50 %	0 %	0 %	385821705
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141	NC_017474	GCC	2	6	6770	6775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821705
142	NC_017474	GAC	2	6	6842	6847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821705
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255	NC_017474	A	7	7	12497	12503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_017474	T	7	7	12535	12541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_017474	ATT	2	6	12542	12547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_017474	A	6	6	12552	12557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_017474	TAG	2	6	12745	12750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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264	NC_017474	TAA	2	6	12826	12831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_017474	TGT	2	6	12841	12846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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267	NC_017474	AAT	2	6	12898	12903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821712
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399	NC_017474	AAC	2	6	19079	19084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
400	NC_017474	ATT	2	6	19138	19143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
401	NC_017474	GACT	2	8	19170	19177	25 %	25 %	25 %	25 %	385821718
402	NC_017474	TCA	2	6	19236	19241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821718
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404	NC_017474	AAAC	2	8	19256	19263	75 %	0 %	0 %	25 %	385821718
405	NC_017474	A	6	6	19293	19298	100 %	0 %	0 %	0 %	385821718
406	NC_017474	TCA	2	6	19307	19312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821718
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414	NC_017474	AT	3	6	19645	19650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
415	NC_017474	AC	3	6	19689	19694	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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426	NC_017474	A	8	8	20226	20233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_017474	ATT	2	6	20406	20411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821720
433	NC_017474	CGC	2	6	20440	20445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821720
434	NC_017474	ATAA	2	8	20484	20491	75 %	25 %	0 %	0 %	385821720
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460	NC_017474	TA	3	6	21786	21791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_017474	GAT	2	6	21915	21920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
462	NC_017474	CAG	3	9	21921	21929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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496	NC_017474	GAC	2	6	23586	23591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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